A lo largo de la historia de la Hermandad, son varias las sedes canónicas donde a residido. Cuando la Hermandad se creó en 1957 tuvo su sede en el Patronato Católico de Nuestra Señora de la Merced, sita en calle Ponce.

Tres años más tarde en 1960, pasaría a la iglesia de la Victoria, compartiendo sede con la Hermandad del Sagrado Descendimiento, donde radicó hasta la fecha de 1981. Actualmente existe un hermanamiento con la mencionada Hermandad intercambiando un nazareno en el cortejo.

En octubre de 1981 pasó a se la iglesia parroquial de Santiago el Real y del Refugio la Sede de la Hermandad, compartiendo iglesia asi mismo con la Hermandad del Prendimiento.

Desde marzo de 2005 y debido al mal estado de la iglesia de Santiago, la hermandad se trasladó al salón de pasos de la casa de hermandad transformándolo en capilla, donde se viene celebrando hasta la fecha todos los cultos.